Mimarlar Odası özellikle komşu ülkeler olmak üzere bölge ülkeleriyle mesleki ve kültürel işbirliği ve iletişimi önemsemekte, bu konuda işbirliği protokolleri ile somut adımlar atılmaya çalışmaktadır. Mimarlar Odası’nın şu ana kadar yedi ülke ile bağıtlanmış işbirliği protokolleri bulunmaktadır:

• Azerbaycan (Azerbaycan Mimarlar İttifakı, 5.1.1999)
• Bulgaristan (Bulgaristan Mimarlar Birliği, 6.6.2001)
• Makedonya (Makedonya Mimarlar Birliği, 9.7.2005)
• Suriye (Suriye Mühendisler ve Mimarlar Birliği, 2000 ve 24.9.2005) 
• Kuzey Kıbrıs Türk Cumhuriyeti (KKTC) (Kıbrıs Türk Mimarlar Odası, 10.3.2006)
• Ermenistan (Ermenistan Mimarlar Birliği, 10 Temmuz 2007)
• İtalya (Roma) (İtalya Mimarlık, Planlama, Koruma ve Peyzaj Mimarları Konseyi (CNAPPC) Roma Şubesi, 12.5.2009)
• Romanya (Romanya Mimarlar Birliği, 15.10.2010)

Protokoller temel olarak ülkelerin düzenlemekte oldukları mesleki ve kültürel etkinlikler konusunda karşılıklı bilgilendirme yapması, teknik ziyaretlerin gerçekleştirilmesi, ortak seminerler düzenlenmesi, sergi ve yayın değişimi yapılması ve ortak araştırma ve projeler geliştirilerek yürütülmesi gibi ilkeler üzerine kuruludur.